大學的教學單位現(xiàn)分為20個學院，這些
　　學院中又分為總共178個研究所，以及為醫(yī)學院實習用的診所。慕尼黑大學成就較高的學院主要有國民經(jīng)濟學院、企業(yè)經(jīng)濟學院、醫(yī)學院、法學院、社會學學院、物理學院和化學學院、林學院、獸醫(yī)學院等。幾乎涵蓋了所有的學科領(lǐng)域。因此，慕尼黑大學實為傳統(tǒng)定義下名副其實的綜合性大學“universitas”。
　　01 天主教神學院
　　02 基督教神學院
　　03 法學院
　　04 企業(yè)經(jīng)濟學院
　　05 國民經(jīng)濟學院
　　07 醫(yī)學院（包括牙醫(yī)學）
　　08 獸醫(yī)學院
　　09 歷史及藝術(shù)學院
　　10 哲學，科學理論及宗教學院
　　11 心理學及教育學院
　　12 文化學院
　　13/14 語言學及文學院
　　15 社會學院
　　16 數(shù)學，信息學及統(tǒng)計學院
　　17 物理學院
　　18 化學及藥學院
　　19 生物學院
　　20 地質(zhì)學院