建校初期的柏林洪堡大學(xué)(Humboldt-Universitat zu Berlin，縮寫(xiě)HU Berlin)有4個(gè)經(jīng)典學(xué)院：法學(xué)院，醫(yī)學(xué)院，哲學(xué)院，神學(xué)院。此后在許多著名學(xué)者的教學(xué)研究推動(dòng)下，該校又發(fā)展了許多新的學(xué)科與專業(yè)，并很快發(fā)展成為一所享譽(yù)全球的一流學(xué)府。洪堡大學(xué)共設(shè)有11個(gè)專業(yè)學(xué)院及各種中心研究所，它的醫(yī)學(xué)系是歐洲最大的。學(xué)科包含了人文、社會(huì)、文化、人類醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)和自然科學(xué)等領(lǐng)域的所有基礎(chǔ)學(xué)科，還設(shè)有全德國(guó)惟一開(kāi)設(shè)的學(xué)科-社會(huì)性科學(xué)。專業(yè)齊全，現(xiàn)有224個(gè)專業(yè)，其中19個(gè)專業(yè)設(shè)有理科碩士專業(yè)，59個(gè)專業(yè)設(shè)有文科碩士專業(yè)。此外包括了12個(gè)語(yǔ)種的翻譯專業(yè)，其中4個(gè)是東歐語(yǔ)言。

　　柏林洪堡大學(xué)以理科、人文、社科、生命科學(xué)最為擅長(zhǎng)，工科相對(duì)較弱。在2015年QS的排名上，柏林洪堡大學(xué)的地理、社會(huì)學(xué)、現(xiàn)代語(yǔ)均排名德國(guó)第一;工程方面，計(jì)算機(jī)科學(xué)是柏林洪堡大學(xué)最為突出的專業(yè)，排名德國(guó)第三，僅次于慕尼黑工業(yè)大學(xué)和卡爾斯魯厄理工學(xué)院；理科方面，數(shù)學(xué)排名最高，為德國(guó)第三位。在2014年上交大的排名上，柏林洪堡大學(xué)表現(xiàn)最好的也是數(shù)學(xué)——排名德國(guó)第三。